近年来，曲靖市委、市政府始终坚持以习近平生态文明思想为统领，牢固树立“绿水青山就是金山银山”理念，统筹“山水林田湖草沙”系统治理，强化以国家公园为主体的自然保护地体系建设，大力保护珍稀濒危野生动植物，维护好生态系统多样性、物种多样性和遗传多样性，全力保护全市生态系统的原真性和完整性。

曲靖市跨滇东北高山峡谷生态区、滇中高原生态区、高原湖盆生态区、哀牢山东部岩溶山原生态区、滇东南生态区，孕育了丰富的生物多样性及生物资源。曲靖市既有著名的乌蒙山湿润常绿阔叶林类型，又有金沙江下游干热、干暖河谷区类型，还有滇东北高山寒温性与高山沼泽化草甸类型。同时，曲靖市还是《中国生物多样性保护区战略与行动计划》（2011－2030年）确定的内陆陆地和水域生物多样性保护优先区域“中南西部山地丘陵区”的重点保护对象。目前全市共有39个自然保护地，批复总面积366416.76公顷，占全市国土面积的12.66%，其中有22个自然保护区、6个森林公园、7个风景名胜区、1个湿地公园、1个地质公园、1个沙漠公园、1个水利风景区。

曲靖市高度重视生物多样性保护工作，坚持规划引领创新保护，建立了曲靖市生物多样性保护联席会议制度，制定《曲靖市贯彻落实<云南省生物多样性保护战略与行动计划（2012－2030年）三年实施方案>实施意见的通知》等一系列文件及法规，设立了生物多样性保护专项资金，从2017年起市级财政按环保专项资金总额不低于5%的比例设立生物多样性保护专项资金。持续推进生物多样性保护监管，联合组织实施“绿盾”自然保护地强化监督工作，组织实施各级自然保护区人类活动遥感监测核查及问题整改，开展国家级自然保护区管理成效评估。不断筑牢生物安全屏障，先后开展了沾益区、会泽县、师宗县、富源县、罗平县等生物多样性保护优先区域生物多样性资源的基础调查评估工作，建立农业转基因执法监管查办案件月报制度，开展有害生物及外来入侵物种的警惕与预防。开展农业生物多样性传统资源调查评估，制定与生物多样性保护相协调的生物产业原料基地、加工生产基地发展布局规划，开展少数民族生物多样性相关传统知识普及，加强土著鱼类资源的保护和可持续利用，大力推动生物多样性可持续利用。

以河长制为抓手，曲靖市促进水生态环境保护，全面建立两级督察、四级河长、五级河长制治理体系，全市1015条（段）河流、963座水库、699条渠道确定3745名河长，做到五级书记亲自抓、河湖库渠全覆盖。创新建立跨省河（湖）管理保护联动机制，曲靖市、黔西南州、六盘水市两省三地黄泥河管理保护联动机制建立。创新建立民间河长选聘制度，正式聘请45名“民间河长”作为“官方河长”的有益补充。此外，曲靖市加大生物多样性保护宣传力度，结合2月2日国际湿地日、5月22日国际生物多样性日、6月5日世界环境日等开展宣传教育活动。建成陆良花木山等5个云南省生态文明教育基地，以“陆良八老”为引领，着力提升公众生态保护意识，弘扬传播生态文明。

经过多年努力，全市自然保护地、野生动植物保护工作取得显著成效，生物多样性日益丰富，森林草原湿地生态系统得到很好的保护与修复。截至目前，全市森林覆盖率达40.2%，森林蓄积量达7072.8万立方米，草原综合植被盖度达85.5%；野生动植物数量不断增加，黑颈鹤从1986年发现的21只增加到现在的1716只；在罗平万峰山市级自然保护区，首次拍摄到国家一级重点保护动物黑颈长尾雉活动的影像。全市有种子植物3000多种，分布有黄杉、中华杪椤、榉树等20多种国家重点保护野生植物；有脊椎动物430多种，分布有黑颈鹤、猕猴、白腹锦鸡等60多种国家重点保护野生动物。